Perbedaan utama antara cotransport dan countertransport adalah cotransport adalah bentuk transpor aktif sekunder yang mengangkut dua jenis molekul secara bersamaan melintasi membran plasma ke arah yang sama atau arah berlawanan. Di sisi lain, countertransport adalah salah satu dari dua bentuk cotransport yang mengangkut dua jenis molekul secara bersamaan dalam arah yang berlawanan satu sama lain melintasi membran sel.
Molekul masuk dan keluar melalui membran plasma selektif sel. Ada beberapa jenis protein pengangkut membran. Cotransport dan countertransport adalah dua jenis transpor aktif sekunder. Cotransport mengangkut dua jenis molekul yang berbeda pada saat yang sama dalam gerakan berpasangan sementara countertransport atau exchange adalah jenis cotransport yang mengangkut dua jenis molekul ke arah yang berlawanan melintasi membran.