Perbedaan utama antara konfigurasi R dan S adalah bahwa konfigurasi R adalah pengaturan spasial isomer R, yang memiliki arah urutan prioritas relatif searah jarum jam sedangkan konfigurasi S adalah pengaturan spasial isomer S yang memiliki arah prioritas relatifnya. memesan dalam arah berlawanan arah jarum jam. Di sini, arah relatif urutan prioritas adalah urutan prioritas substituen yang menurun.
Isomer R dan S adalah molekul organik yang memiliki pusat kiral, yang merupakan atom karbon yang memiliki empat substituen berbeda yang melekat padanya. Substituen ini dicantumkan menurut prioritasnya (prioritas ditentukan menggunakan aturan CIP seperti yang dijelaskan di bawah).