Perbedaan utama antara transpor anterograde dan retrograde adalah bahwa transpor anterograde memindahkan material fisiologis menuju terminal presinaptik sementara transpor retrograde memindahkan material fisiologis kembali ke badan sel dari pinggiran.
Transpor aksonal adalah proses fisiologis yang mengangkut protein dan zat lain yang disintesis di neurosom ke ujung saraf melalui sitoskeleton. Dengan kata sederhana, ini adalah proses yang melibatkan transfer material antara badan sel dan terminal aksonal neuron. Akson mampu melakukan transportasi dua arah. Berdasarkan arah aliran material, ada dua kategori transpor aksonal yaitu transpor aksonal anterograde dan retrograde. Dalam transpor anterograde, material diangkut menuju terminal presinaptik sedangkan pada transpor retrograde, material diangkut dari pinggiran menuju badan sel. Selain itu, kinesin motor memfasilitasi transportasi anterograde sementara dyneins motor memfasilitasi transportasi retrograde.