Perbedaan utama antara genokopi dan fenokopi adalah bahwa dalam genokopi, fenotipe menunjukkan kesamaan dan perubahan genotipe, sedangkan pada fenokopi, fenotipe bervariasi dan genotipe tetap tidak berubah.
Perbedaan antara genokopi dan fenokopi terlibat dalam menjelaskan kejadian langka genetika. Kedua konsep tersebut menunjukkan bagaimana genetika tradisional atau genetika Mendel dapat bervariasi berdasarkan pengecualian di alam. Genocopy mengacu pada fenomena pemberian fenotipe yang serupa meskipun memiliki genotipe yang berbeda. Sebaliknya, fenokopi mengacu pada fenomena memiliki fenotipe yang bervariasi meskipun genotipe tetap tidak berubah.
