Perbedaan utama antara hnRNA dan mRNA adalah bahwa hnRNA adalah transkrip mRNA prematur yang belum diproses yang mengandung intron sedangkan mRNA adalah RNA yang diproses yang tidak mengandung intron.
Ada berbagai jenis RNA, dan hnRNA dan mRNA adalah dua jenis di antaranya. RNA inti heterogen, juga dikenal sebagai pra-mRNA, adalah jenis transkrip primer yang diproduksi di dalam nukleus. Setelah pra-mRNA dibuat, itu diproses secara pasca-transkripsi menjadi mRNA fungsional, yang dapat diterjemahkan menjadi protein di sitoplasma. Oleh karena itu, hnRNA disintesis dari cetakan DNA, dan merupakan RNA yang baru terbentuk sebelum diproses. mRNA adalah urutan RNA yang membawa informasi genetik untuk menghasilkan protein. Ini adalah bentuk RNA setelah diproses. Selain itu, mRNA membawa kodon genetik dari DNA di dalam nukleus ke ribosom untuk sintesis protein.
