Perbedaan utama antara sentromer dan kromomer adalah bahwa sentromer adalah daerah terbatas yang menggabungkan kromatid saudara bersama dalam sebuah kromosom sedangkan kromomere adalah struktur seperti manik yang tersusun secara linier yang ada di sepanjang kromosom.
Kromosom adalah struktur seperti benang yang terdiri dari asam nukleat dan protein. Mereka berisi informasi genetik suatu organisme. Ada beberapa daerah berbeda dalam kromosom, termasuk kromatid, sentromer, kromomer, dan telomer. Sentromer adalah titik penyempitan yang terlihat di kromosom. Ini bergabung dengan kromatid saudara bersama dan penting selama pembelahan sel. Sebaliknya, kromomer adalah kromatin yang melingkar erat di sepanjang kromosom. Mereka muncul sebagai manik-manik di tali. Mereka membawa gen selama pewarisan.