Perbedaan utama antara pewarnaan progresif dan regresif adalah bahwa dalam pewarnaan progresif, jaringan dibiarkan dalam larutan pewarnaan cukup lama untuk mencapai titik akhir yang diinginkan sementara dalam pewarnaan regresif, jaringan sengaja dibiarkan untuk pewarnaan berlebih sampai pewarna memenuhi semua elemen jaringan dan kemudian bersihkan noda.
Pewarnaan adalah teknik yang menonjolkan dan membedakan komponen jaringan dan membuatnya layak untuk diamati di bawah mikroskop. Pewarnaan H dan E adalah prosedur pewarnaan jaringan umum yang paling sering digunakan dalam histologi. Ini menggunakan haematoxylin dan eosin (counterstain). Pewarnaan nuklir menggunakan hematoksilin dapat dilakukan dengan teknik pewarnaan progresif atau regresif. Beberapa formulasi hematoksilin digunakan untuk pewarnaan progresif. Haematoxylin Mayer adalah salah satu contohnya. Noda progresif memiliki konsentrasi hematoksilin yang rendah. Oleh karena itu, mereka perlahan dan selektif menodai kromatin. Beberapa formulasi lain digunakan dalam pewarnaan regresif. Harris haematoxylin digunakan dalam pewarnaan regresif. Pewarnaan regresif memiliki konsentrasi hematoksilin yang tinggi; karenanya, noda dengan cepat menyebar ke seluruh sel.
