Perbedaan utama antara porins dan aquaporin adalah porins adalah pori-pori dan saluran berisi air yang ditemukan di membran bakteri dan eukariota. Sedangkan aquaporin merupakan protein membran yang membentuk saluran selektif air pada sel makhluk hidup.
Molekul yang berbeda masuk dan keluar sel melintasi membran plasma pada organisme hidup. Dengan demikian, terdapat protein membran yang berbeda dalam membran plasma untuk menjaga dan mengatur molekul yang masuk dan keluar dari sel. Porins dan aquaporin adalah dua jenis protein membran. Porins adalah pori-pori berisi air yang memfasilitasi transportasi molekul hidrofilik melintasi membran. Sementara itu, aquaporin merupakan saluran selektif air yang secara khusus memungkinkan air lewat dengan bebas melintasi membran.
