Perbedaan utama antara protomer dan kapsomer adalah bahwa protomer adalah unit struktural protein oligomer sedangkan kapsomer adalah protein individu yang terdiri dari protomer, yang merupakan subunit struktural dari kapsid virus.
Virus adalah parasit obligat intraseluler, yang merupakan partikel menular. Kapsid adalah salah satu dari dua komponen utama partikel virus. Ini adalah lapisan protein yang mengelilingi dan melindungi genom virus. Kapsid terdiri dari protomer, yang merupakan unit struktural protein oligomer. Capsomere adalah subunit struktural kapsid virus, dan merupakan agregasi dari beberapa protomer sebagai satu unit. Dengan demikian, protomer berkumpul sendiri untuk membentuk kapsomer dan kapsomer berkumpul sendiri untuk membentuk kapsid.
