Perbedaan utama antara mikoplasma dan klamidia adalah bahwa mikoplasma adalah genus bakteri yang tidak memiliki dinding sel sedangkan klamidia adalah genus bakteri yang mencakup parasit gram negatif dan obligat.
Spesies mikoplasma adalah bakteri terkecil yang telah ditemukan, dengan genom terkecil dan jumlah minimum organel yang sangat penting. Mycoplasma adalah bakteri tanpa dinding. Karenanya, mereka tidak memiliki bentuk yang pasti. Umumnya, mereka berbentuk bola hingga sel berbentuk filamen. Sebaliknya, klamidia adalah genus bakteri yang memiliki dinding sel. Mereka adalah bakteri gram negatif. Baik mikoplasma dan klamidia menyebabkan penyakit menular seksual. Selain itu, gejala yang timbul serupa, tetapi dapat diobati dengan antibiotik yang berbeda.
