Perbedaan utama antara Ubiquinones dan Cytochromes adalah Ubiquinones (CoQ) bukan protein sedangkan Cytochromes adalah protein.
Rantai transpor elektron adalah tahap akhir dari respirasi aerobik. Oleh karena itu, ini terjadi di membran dalam mitokondria. Selain itu, ia terdiri dari pembawa elektron yang memfasilitasi produksi gradien proton melintasi membran. Selain NAD dan flavoprotein, Ubiquinones dan Cytochromes adalah dua jenis pembawa elektron yang terlibat dalam rantai transpor elektron. Ubiquinones adalah molekul organik hidrofobik non-protein larut lemak, sedangkan sitokrom adalah protein yang mengandung zat besi.
