Perbedaan utama antara fenetik dan kladistik adalah metode yang digunakan dalam mengklasifikasikan organisme. Fenetik mengklasifikasikan organisme berdasarkan fitur morfologis dan struktural sementara kladistik mengklasifikasikan organisme berdasarkan nenek moyang dan hubungan evolusionernya.
Klasifikasi organisme merupakan proses penting dalam keanekaragaman hayati dan studi biologi. Taksonomi memfasilitasi klasifikasi berbagai sistem sambil membantu dalam pengelompokan dan pengelompokan organisme. Dalam hal ini, fenetik dan kladistik memainkan peran penting dalam membangun hubungan antar organisme.