Perbedaan utama antara mikrospora dan butiran serbuk sari adalah bahwa mikrospora adalah spora kecil yang berkembang menjadi gametofit jantan pada tumbuhan sedangkan butiran serbuk sari adalah butiran kecil yang mengandung gametofit jantan.
Reproduksi tanaman berlangsung baik secara seksual maupun aseksual, menunjukkan pergantian generasi. Ada dua generasi yang dikenal sebagai generasi sporofit dan generasi gametofit. Mikrospora dan serbuk sari adalah dua struktur yang berkembang selama dua generasi ini. Mikrospora merupakan struktur generasi sporofit, sedangkan serbuk sari merupakan struktur generasi gametofit. Juga, mikroskop bukanlah gametofit sedangkan serbuk sari adalah gametofit.
