Perbedaan utama antara mikrotubulus dan mikrofilamen adalah tubulin adalah protein yang membuat mikrotubulus sedangkan aktin adalah protein yang membuat mikrofilamen. Juga, mikrotubulus adalah struktur seperti tabung berongga panjang sedangkan mikrofilamen adalah polimer linier dari aktin protein globular.
Serat protein sangat penting untuk menjalankan banyak fungsi dalam sel hidup. Mikrotubulus dan mikrofilamen adalah dua jenis serat yang terjadi di sitoplasma setiap sel eukariotik. Serat-serat ini pada dasarnya bertanggung jawab untuk membuat jaringan silang silang yang dikenal sebagai 'sitoskeleton' dari sitoplasma. Sitoskeleton adalah sistem dinamis yang membantu mempertahankan bentuk sel dan melabuhkan organel sel di dalam sitoplasma. Selain kedua jenis serat tersebut di atas, serat perantara juga penting dalam pembuatan sitoskeleton. Serat tertentu juga membuat struktur penggerak (flagela, silia, dll.), Yang biasanya terdapat pada prokariota tertentu.