Perbedaan utama antara sekretin dan kolesistokinin adalah bahwa sekretin adalah hormon peptida yang diproduksi oleh sel S duodenum dan jejunum sedangkan kolesistokinin adalah hormon peptida lain yang disekresikan oleh sel-sel duodenum.
Hormon adalah bahan kimia yang disintesis oleh kelenjar endokrin. Mereka mengatur sebagian besar fungsi tubuh. Selain itu, berbagai jenis organ mengeluarkan hormon yang berbeda. Di antara berbagai jenis organ, saluran pencernaan adalah organ yang mengeluarkan hormon yang penting untuk pencernaan makanan, dan fungsi terkait. Berbagai bagian saluran pencernaan juga mengeluarkan hormon. Selain itu, duodenum juga mengeluarkan beberapa hormon esensial. Diantaranya, sekretin dan kolesistokinin adalah dua hormon yang diproduksi dan disekresikan bersama saat makanan mencapai lambung. Kedua hormon tersebut adalah hormon peptida yang bertanggung jawab untuk mengatur sekresi lambung dan menjaga lingkungan basa dalam kandungan duodenum.