Perbedaan utama antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid adalah bahwa isolasi DNA genom menargetkan ekstraksi DNA genom sedangkan isolasi DNA plasmid menargetkan ekstraksi DNA plasmid dari bakteri.
Isolasi DNA adalah proses kimia yang digunakan untuk mengisolasi DNA dari spesies berbeda atau dari sampel berbeda. Isolasi DNA penting dalam teknik biologi molekuler hilir, seperti elektroforesis gel, reaksi rantai polimerase, dan teknik sekuensing DNA. Oleh karena itu, isolasi DNA merupakan proses kimiawi yang penting dalam studi biologi molekuler. Berdasarkan tujuan penelitian, terkadang perlu dilakukan isolasi DNA genom. Selain itu, beberapa penelitian berfokus pada isolasi DNA plasmid dari bakteri. Isolasi DNA genom adalah proses mengisolasi DNA genom dari sampel prokariotik atau eukariotik. Langkah-langkah isolasi berbeda menurut jenis sel tempat DNA mengisolasi. Isolasi DNA plasmid adalah proses mengisolasi DNA plasmid dari sel bakteri. Dibandingkan dengan isolasi DNA genom,keseluruhan prosesnya rumit dalam isolasi DNA plasmid.
