Perbedaan utama antara neurotransmiter dan hormon adalah bahwa neurotransmiter adalah pembawa pesan kimiawi yang digunakan oleh sistem saraf untuk mengirimkan impuls saraf melintasi sinapsis sementara hormon adalah pembawa pesan kimiawi yang digunakan oleh sistem endokrin untuk merangsang atau berkomunikasi dengan sel target tertentu.
Sistem saraf dan sistem endokrin merupakan sistem organ yang sangat penting dalam tubuh kita yang mengatur berbagai aktivitas. Kedua sistem bergantung pada pelepasan bahan kimia khusus baik sebagai neurotransmiter atau sebagai hormon. Neurotransmiter dan hormon ini bertindak sebagai pembawa pesan kimiawi dan memfasilitasi transmisi impuls saraf dan pengaturan aktivitas fisiologis dalam tubuh kita.