Perbedaan utama antara kalsium hipoklorit dan natrium hipoklorit adalah bahwa kalsium hipoklorit mengandung dua anion hipoklorit yang terkait dengan satu kation kalsium sedangkan natrium hipoklorit mengandung satu anion hipoklorit yang terkait dengan satu kation natrium. Secara penampilan, kalsium hipoklorit berwarna putih sampai bubuk abu-abu sedangkan natrium hipoklorit berwarna kuning kehijauan dengan bau manis.
Kalsium dan natrium hipoklorit adalah senyawa ionik yang mengandung kation logam dan anion turunan klorin. Jumlah anion per kation senyawa ini berbeda satu sama lain sesuai dengan valensi kation logamnya.
