Perbedaan utama antara motif dan domain adalah bahwa motif tidak stabil secara independen sedangkan domain stabil secara independen.
Protein adalah makromolekul biologis penting yang ada di tubuh kita. Di sisi lain, kode genetik suatu gen akan menentukan urutan asam amino suatu protein. Selain itu, protein memiliki struktur primer, sekunder dan tersier. Struktur utama adalah urutan asam amino dari rantai polipeptida. Ketika rantai polipeptida terlipat satu sama lain, itu membentuk struktur sekunder protein. Heliks alfa, lembaran beta, dan struktur super-sekunder termasuk dalam struktur sekunder. Pengelompokan tertentu dari elemen super-sekunder dikenal sebagai motif protein. Struktur tersier protein mengacu pada struktur tiga dimensinya yang menentukan fungsi protein. Domain adalah bagian terlipat dari molekul protein yang berbentuk bulat dan memiliki fungsi terpisah. Ini adalah struktur fungsional dan tiga dimensi dasar dari protein.