Perbedaan Kunci - VNTR vs STR
Studi DNA memiliki kegunaan yang sangat besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik, dan memetakan genom organisme. Beberapa teknik yang terkait dengan analisis DNA digunakan untuk identifikasi gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenal sebagai penanda genetik. Penanda genetik digunakan dalam biologi molekuler untuk mengidentifikasi variasi genetik antara individu dan spesies. Variable number tandem repeat (VNTR) dan short tandem repeat (STR) merupakan dua jenis penanda genetik yang menunjukkan polimorfisme antar individu. Kedua jenis tersebut adalah DNA berulang tanpa kode yang merupakan pengulangan tandem. Mereka tersusun secara head to tail fashion dalam kromosom. VNTR adalah bagian dari genom di mana urutan nukleotida pendek diulang beberapa kali. STR adalah bagian lain dari DNA dalam genom yang disusun sebagai unit berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas nukleotida dalam seratus kali. Perbedaan utama antara VNTR dan STR adalah jumlah nukleotida dalam urutan yang berulang. Satuan berulang VNTR terdiri dari 10 sampai 100 nukleotida sedangkan satuan berulang STR terdiri dari 2 sampai 13 nukleotida. VNTR dan STR digunakan secara luas dalam studi forensik.
ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu VNTR
3. Apa itu STR
4. Persamaan Antara VNTR dan STR
5. Perbandingan Berdampingan - VNTR vs STR dalam Bentuk Tabel
6. Ringkasan
Apa itu VNTR?
Pengulangan tandem adalah urutan pendek DNA yang diulang dari kepala ke ekor pada lokus kromosom tertentu. Tidak ada urutan atau nukleotida lain dalam pengulangan tandem. Ada beberapa jenis pengulangan tandem dalam genom. VNTR adalah salah satu jenis pengulangan tandem yang memiliki satuan pengulangan yang terdiri dari 10 sampai 100 nukleotida. VNTR adalah jenis satelit mini. Pengulangan tandem ini dapat ditemukan di banyak kromosom. Mereka diselingi dalam genom manusia dan terletak terutama di daerah subtelomer kromosom.
VNTR menunjukkan polimorfisme berulang tandem di antara individu. Panjang VNTR di lokasi kromosom tertentu sangat bervariasi di antara individu karena variasi jumlah unit berulang yang diatur dalam bagian DNA tersebut. Oleh karena itu, VNTR dapat digunakan sebagai alat yang ampuh dalam identifikasi individu dan analisis VNTR digunakan di banyak bidang termasuk genetika, penelitian biologi, forensik dan sidik jari DNA. VNTR adalah penanda genetik pertama yang digunakan untuk mengukur engraftment transplantasi sumsum tulang. VNTR juga merupakan penanda polimorfik pertama yang digunakan dalam pembuatan profil DNA di forensik.
Gambar 01: Variasi VNTR pada enam individu
Analisis VNTR dilakukan melalui polimorfisme panjang fragmen restriksi yang diikuti oleh hibridisasi selatan. Oleh karena itu, diperlukan sampel DNA yang besar. Interpretasi profil VNTR juga bermasalah. Karena keterbatasan ini, penggunaan VNTR dalam genetika forensik telah dibatasi dan digantikan oleh analisis STR.
Apa itu STR?
STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit berulang nukleotida yang diatur secara tandem. STR mirip dengan VNTR. Tetapi itu bervariasi dari VNTR dari jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan jumlah pengulangan. STR adalah sejenis mikrosatelit.
Analisis STR terlibat dalam mengukur jumlah pasti dari unit berulang. STR sangat bervariasi antar individu, mirip dengan VNT. Profil STR berbeda dari orang ke orang. Oleh karena itu, analisis STR digunakan dalam biologi molekuler untuk membandingkan lokus spesifik pada DNA dari dua sampel atau lebih. Oleh karena itu STR dianggap sebagai penanda genetik yang kuat dalam biologi molekuler. Ini memberikan alat yang sangat baik untuk identifikasi individu karena tingkat polimorfisme mereka yang tinggi dan panjang yang relatif pendek.
Saat ini, STR adalah alat polimorfisme genetik yang dianalisis paling umum digunakan dalam genetika forensik. Kebanyakan kasus forensik melibatkan analisis polimorfik STR. Lokus STR tersebar di seluruh genom. Ada ribuan STR yang terletak di kromosom yang dapat digunakan dalam analisis forensik. Analisis STR tidak melibatkan polimorfisme panjang pembatasan seperti analisis VNTR. Analisis STR tidak memotong DNA dengan enzim restriksi. Probe khusus digunakan untuk menempelkan daerah yang diinginkan pada DNA dan menggunakan teknik PCR, panjang STR ditentukan.
Gambar 02: Variasi STR antar sampel
Apa Persamaan Antara VNTR dan STR?
- VNTR dan STR adalah DNA tanpa kode.
- Keduanya adalah pengulangan tandem.
- Keduanya menunjukkan polimorfisme antar individu karena perbedaan panjang bagian DNA.
- Keduanya digunakan sebagai penanda genetik yang kuat dalam pencetakan jari DNA dan dalam studi forensik.
Apa Perbedaan Antara VNTR dan STR?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
VNTR vs STR |
|
| VNTR adalah DNA berulang tanpa kode yang memiliki urutan nukleotida pendek yang diulang secara tandem. | STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit berulang nukleotida yang diatur secara tandem. |
| Ukuran | |
| VNTR lebih besar dari STR. | STR lebih kecil dari VNTR. |
| Jumlah Nukleotida dalam Urutan Berulang | |
| Unit pengulangan VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. | Unit berulang STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. |
Ringkasan - VNTR vs STR
VNTR dan STR adalah dua penanda genetik yang kuat yang digunakan dalam biologi molekuler, terutama di bidang genetika forensik. VNTR adalah jenis minisatelit dan STR adalah mikrosatelit. VNTR dan STR adalah noncoding, DNA yang sangat repetitif. Itu adalah pengulangan tandem. Struktur umum VNTR dan STR sama. Namun, jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan panjangnya berbeda. VNTR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 10 sampai 100 nukleotida. STR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. Inilah perbedaan antara VNTR dan STR.
Unduh Versi PDF VNTR vs STR
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silahkan download versi PDF disini Perbedaan Antara VNTR dan STR.
