Perbedaan utama antara haematoxylin Harris dan Mayer adalah bahwa haematoxylin Harris digunakan dalam pewarnaan regresif sedangkan haematoxylin Mayer digunakan dalam pewarnaan progresif.
Haematoxylin adalah pewarna dasar yang umum digunakan dalam histopatologi. Ini adalah pewarna alami yang diekstrak dari pohon Haematoxylon campechianum. Ini adalah pewarna warna biru tua atau ungu. Haematoxylin memungkinkan demonstrasi detail inti mikroskopis dari komponen seluler dan jaringan. Pewarna ini bermuatan positif, oleh karena itu, mengikat dengan zat bermuatan negatif seperti DNA dan RNA dan menodainya dengan warna ungu. Haematoxylin membutuhkan mordan untuk membantu penyambungan dengan komponen jaringan. Mordan adalah bahan kimia, terutama garam dari aluminium, besi, tungsten, yang memfasilitasi hubungan pewarna ke komponen jaringan.
Berdasarkan mordan yang dikandungnya, ada beberapa jenis haematoxylins yang tersedia. Beberapa di antaranya adalah haematoxylins milik Ehrlich, Mayer's, Harris ', Gill's, Delafield's, Cole's dan Carazzi. Formulasi haemoxylin Harris dan Mayer adalah haematoxylins mordan berbahan dasar aluminium.