Perbedaan Antara CRISPR Dan RNAi

2024 Pengarang: Mildred Bawerman | [email protected]. Terakhir diubah: 2023-12-16 08:39

Perbedaan Kunci - CRISPR vs RNAi

Pengeditan genom dan modifikasi gen adalah bidang minat yang akan datang dalam genetika dan biologi molekuler. Modifikasi gen dapat diterapkan secara luas untuk studi terapi gen dan juga digunakan untuk mengidentifikasi sifat-sifat gen, fungsionalitas gen dan bagaimana mutasi pada gen dapat mempengaruhi fungsinya. Penting untuk mengembangkan cara yang efisien dan andal untuk membuat perubahan yang tepat dan tepat sasaran pada genom sel hidup. Teknik seperti CRISPR dan RNAi digunakan untuk memodifikasi gen dengan presisi tinggi. CRISPR atau Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats adalah mekanisme pertahanan kekebalan prokariotik yang terjadi secara alami yang baru-baru ini digunakan untuk mengedit dan memodifikasi gen eukariotik. Interferensi RNAi atau RNA adalah metode spesifik urutan untuk membungkam gen dengan memasukkan RNA untai ganda kecil yang memediasi asam nukleat dan mengatur ekspresi gen. Inilah perbedaan utama antara CRISPR dan RNAi.

ISI

1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama

2. Apa itu CRISPR

3. Apa itu RNAi

4. Persamaan Antara CRISPR dan RNAi

5. Perbandingan Berdampingan - CRISPR vs RNAi dalam Bentuk Tabel

6. Ringkasan

Apa itu CRISPR?

Sistem CRISPR adalah mekanisme alami yang terdapat pada beberapa bakteri termasuk E. coli dan archea. Ini adalah perlindungan kekebalan adaptif terhadap invasi berbasis DNA asing. Ini adalah mekanisme spesifik urutan. Sistem CRISPR berisi beberapa elemen pengulangan DNA. Elemen-elemen ini diselingi dengan sekuens pendek “spacer” yang berasal dari DNA asing dan beberapa gen Cas. Beberapa gen Cas adalah nuklease. Jadi, sistem kekebalan lengkap disebut sebagai sistem CRISPR / Cas.

Gambar 01: Sistem CRISPR / Cas

Sistem CRISPR / Cas berfungsi dalam empat langkah.

1. Sistem ini secara genetik menambatkan segmen DNA fag dan plasmid yang menyerang (spacer) ke lokus CRISPR (disebut langkah akuisisi spacer).
2. Langkah pematangan crRNA - Host mentranskripsikan dan memproses lokus CRISPR untuk menghasilkan CRISPR RNA (crRNA) dewasa yang berisi elemen berulang CRISPR dan elemen pengatur jarak terintegrasi.
3. Deteksi crRNA - Ini difasilitasi oleh pasangan basa komplementer. Ini penting jika ada infeksi dan agen penular ada.
4. Langkah interferensi target - crRNA mendeteksi DNA asing, membentuk kompleks dengan DNA asing dan melindungi inang terhadap DNA asing.

Saat ini, sistem CRISPR / Cas digunakan untuk mengubah atau memodifikasi genom mamalia baik dengan represi atau aktivasi transkripsi. Sel mamalia dapat merespons kerusakan DNA yang dimediasi CRISPR / Cas9 dengan mengadopsi mekanisme perbaikan. Ini dapat dilakukan dengan menggunakan metode penggabungan ujung non-homolog (NHEJ) atau perbaikan diarahkan homologi (HDR). Kedua mekanisme perbaikan ini terjadi dengan memperkenalkan jeda untai ganda. Ini menghasilkan pengeditan gen mamalia. Dengan demikian saat ini sistem CRISPR / Cas digunakan di bidang aplikasi terapeutik, biomedis, pertanian dan penelitian.

Apa itu RNAi?

Interferensi RNA adalah teknik mediasi RNA untai ganda, yang digunakan untuk mengatur ekspresi gen. Senyawa utama yang terlibat adalah RNA kecil yang mengganggu (siRNA). SiRNA adalah tipe khusus dari RNA untai ganda dengan 3 'overhang dari dua nukleotida, dan gugus fosfat 5'. RNA induced silencing complex (RISC) terbentuk selama interferensi RNA yang akan mengakibatkan degradasi gen yang terikat pada siRNA.

Gambar 02: RNAi

Prosedur RNAi adalah sebagai berikut.

1. RNA untai ganda akan diproses di sitoplasma oleh endoribonuklease tipe RNase III yang disebut Dicer untuk menghasilkan ~ 21 siRNA nukleotida panjang
2. Transfer Dicer terikat siRNA ke Argonaute, dengan bantuan protein pengikat RNA untai ganda (dsRNABP).
3. Pengikatan Argonaute ke satu untai dupleks (untai pemandu). Ini akan menggantikan untai lainnya. Ini menghasilkan seluruh protein - kompleks RNA yang disebut RISC.
4. Pemasangan kompleks RISC dengan RNA pemandu untai tunggal terikat ke Argonaute.
5. Pemasangan target RNA homolog dengan RNA pemandu.
6. Aktivasi Argonaute mengakibatkan degradasi RNA target

Apa Persamaan Antara CRISPR dan RNAi?

Keduanya digunakan sebagai alat penelitian modifikasi ekspresi gen

Apa Perbedaan Antara CRISPR dan RNAi?

Artikel Diff Tengah sebelum Tabel

CRISPR vs RNAi
CRISPR adalah mekanisme pertahanan kekebalan yang baru-baru ini digunakan untuk mengedit dan memodifikasi gen eukariotik.	RNAi adalah metode spesifik urutan untuk membungkam gen dengan memasukkan untai ganda kecil
Urutan Penargetan
Synthetic RNA (guide RNA) adalah urutan penargetan CRISPR.	siRNA adalah urutan penargetan RNAi.
Efisiensi dalam Supresi Gen
Rendah CRISPR	Tinggi RNAi
Efek
Knockdown gen terjadi di CRISPR.	Knockout / silencing terjadi di RNAi.

Ringkasan - CRISPR vs RNAi

CRISPR atau Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats adalah mekanisme pertahanan kekebalan prokariotik yang terjadi secara alami yang baru-baru ini digunakan untuk mengedit dan memodifikasi gen eukariotik. Interferensi RNAi atau RNA adalah metode spesifik urutan untuk membungkam gen dengan memasukkan RNA untai ganda kecil yang menengahi asam nukleat dan mengatur ekspresi gen. Ini dapat dianggap sebagai perbedaan mendasar antara CRISPR dan RNAi. Kedua teknik tersebut, CRISPR / Cas dan RNAi, adalah alat yang ampuh untuk manipulasi gen meskipun CRISPR / Cas jelas lebih unggul daripada RNAi karena dapat digunakan untuk menginduksi penyisipan dan penghapusan. Kekhususannya juga tinggi dalam sistem CRISPR / Cas.

Unduh Versi PDF CRISPR vs RNAi

Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silahkan download versi PDF disini Perbedaan Antara CRISPR dan RNAi