Perbedaan utama antara amonia dan amonium adalah bahwa amonia adalah molekul polar tak bermuatan yang ada sebagai gas pada suhu kamar, sedangkan ion amonium bermuatan dan ada sebagai ion bebas dalam larutan atau sebagai senyawa garam yang mengkristal.
Ada beberapa gambaran dan bahkan bau tertentu yang pikiran kita segera kaitkan dengan amonia atau amonium; ini termasuk pupuk, limbah nitrogen, sabun, dan bahkan bahan peledak. Apalagi, kebanyakan orang beranggapan bahwa tidak ada perbedaan antara amonia dan amonium. Kemiripan yang tinggi antara keduanya, dan penggunaan kata amonia lebih sering sebagai istilah umum untuk senyawa amonia murni dan amonium adalah yang menyebabkan kebingungan ini.