Perbedaan utama antara anafase I dan anafase II adalah bahwa selama anafase I, kromosom homolog dipisahkan dan ditarik ke arah kutub yang berlawanan sementara selama anafase II, kromatid saudara dipisahkan dan ditarik ke arah kutub sel yang berlawanan.
Mitosis dan meiosis adalah dua bentuk pembelahan inti yang terjadi di dalam sel. Akibat mitosis, nukleus membelah menjadi dua sel anak, dan masing-masing memiliki nomor kromosom yang sama dengan inti induk. Namun, pada meiosis, jumlah kromosom inti yang dimiliki sel anak dibelah dua dari inti induk. Meiosis terjadi selama pembentukan sel kelamin seperti sperma dan telur untuk melakukan reproduksi seksual. Oleh karena itu, sebagai akibat dari meiosis, satu sel induk menghasilkan empat sel anak yang mengandung setengah dari kromosom sel induk.
Selanjutnya, rekombinasi genetik terjadi selama meiosis. Oleh karena itu, gamet yang dihasilkan berbeda secara genetik, dan keturunan yang dihasilkan juga berbeda secara genetik. Meiosis mencakup dua divisi nuklir berturut-turut; yaitu meiosis I dan meiosis II. Baik meiosis I dan meiosis II memiliki empat fase, yaitu profase, metafase, anafase, dan telofase.