Perbedaan utama antara kerangka organik kovalen dan kerangka organik logam adalah bahwa kerangka organik kovalen adalah struktur yang memiliki ikatan kovalen sedangkan kerangka organik logam adalah struktur yang memiliki ikatan koordinasi.
Kerangka organik kovalen dan logam merupakan golongan senyawa yang memiliki sifat unik. Kedua kelas ini mengandung bahan yang dikenal sebagai senyawa padat organik. Umumnya kerangka organik kovalen adalah senyawa yang memiliki sifat dua atau tiga dimensi sedangkan kerangka organik logam adalah senyawa yang memiliki sifat satu, dua atau tiga dimensi.