Perbedaan utama antara pewarisan sitoplasma dan pewarisan inti adalah bahwa pewarisan sitoplasma terjadi dari gen yang ada dalam organel sitoplasma sedangkan pewarisan inti terjadi dari gen yang ada di kromosom.
Fertilisasi adalah perpaduan gamet jantan dan betina bersama. Oleh karena itu, selama pembuahan, sperma haploid dan sel telur haploid bersatu dan membentuk zigot diploid. Sel sperma mentransfer nukleusnya ke sel telur untuk fusi. Zigot yang dihasilkan memiliki sitoplasma sel telur. Dengan kata sederhana, sitoplasma sel telur menjadi sitoplasma zigot. Selain itu, keturunannya menerima gen dari inti dan gen organel sitoplasma ibu. Gen inti dan gen organel sitoplasma diwarisi oleh keturunannya. Oleh karena itu, ada dua jenis pewarisan yang terjadi selama pembuahan seksual. Mereka adalah warisan sitoplasma dan warisan nuklir.