Perbedaan utama antara fase balik dan fase normal HPLC adalah bahwa fase balik HPLC menggunakan fase diam nonpolar dan fase gerak polar sedangkan HPLC fase normal menggunakan fase diam polar dan fase gerak kurang polar.
HPLC fase normal adalah teknik HPLC tertua yang digunakan Tswett dalam pemisahan ekstrak tumbuhannya; dia menggunakan kapur di kolom kaca. Ini adalah mode klasik kromatografi yang kemudian menamainya sebagai teknik "normal". HPLC fase terbalik, sebaliknya, adalah kebalikan dari teknik normal, yang dikembangkan para ilmuwan belakangan ini.