Perbedaan utama antara esterase dan lipase adalah bahwa esterase adalah enzim yang menghidrolisis ester rantai pendek asil yang larut dalam air sedangkan lipase adalah enzim yang menghidrolisis triasilgliserol rantai panjang yang tidak larut dalam air.
Hidrolase adalah enzim yang mengkatalisasi pada dasarnya, hidrolisis senyawa organik. Di bidang lipid dan pencernaan lemak serta hidrolisis, ada dua jenis hidrolase utama yang terlibat. Mereka adalah esterase dan lipase. Esterase adalah enzim yang mengkatalisis hidrolisis senyawa ester. Sebagai perbandingan, lipase termasuk dalam subset esterase. Ini mengkatalisis hidrolisis lipid, terutama selama pencernaan. Esterase adalah zat yang larut dalam air sedangkan lipase tidak larut dalam air dan sangat teragregasi dalam air.