Perbedaan utama antara mikrofag dan makrofag adalah bahwa mikrofag adalah jenis fagosit kecil yang hanya hidup selama beberapa hari sedangkan makrofag adalah jenis fagosit yang lebih besar dengan umur yang lebih lama.
Sistem kekebalan kita melawan mikroorganisme patogen yang menyerang dan membuat kita tetap aman. Oleh karena itu, ini adalah sistem kompleks yang menjalankan banyak mekanisme pertahanan berbeda untuk mendeteksi penyerang dan menghancurkannya. Fagositosis adalah salah satu mekanisme di mana fagosit menelan partikel yang menyerang dan membunuhnya. Fagosit adalah sel yang mampu menelan dan menyerap bakteri, dan sel asing lainnya serta partikel infeksius menghancurkan di dalamnya. Dengan demikian, ada dua jenis fagosit utama yaitu mikrofag dan makrofag. Mikrofag adalah fagosit polimorfonuklear kecil yang hadir dalam jumlah besar. Di sisi lain, makrofag adalah jenis fagosit yang ditempatkan di beberapa lokasi penting di tubuh kita untuk bertindak sebagai mekanisme pertahanan garis depan terhadap partikel yang menyerang. Mereka adalah pemakan besar dalam sistem kekebalan kita.