Perbedaan utama antara eksoskeleton dan endoskeleton adalah bahwa exoskeleton adalah kerangka eksternal yang ada di luar tubuh hewan sedangkan endoskeleton adalah kerangka internal yang ada di dalam tubuh hewan.
Tubuh makhluk hidup, baik itu lebah madu atau manusia, adalah jaringan kompleks dari berbagai organ. Organ-organ ini menjalankan beberapa fungsinya sendiri selain terhubung satu sama lain untuk tubuh yang harmonis, seimbang, dan fungsional. Semuanya merupakan keajaiban alam yang kompleks karena setiap spesies memiliki keistimewaan tersendiri. Beberapa hanya memiliki endoskeleton sementara beberapa hanya memiliki exoskeleton sementara beberapa memiliki keduanya untuk penyangga. Seperti namanya, exoskeleton berada di luar tubuh sementara endoskeleton berada di dalam tubuh. Kerangka luar melindungi dan juga menopang tubuh hewan. Di sisi lain, endoskeleton memberikan dukungan dan perlindungan bagi organ dalam yang lebih lembut dan rapuh seperti jantung, paru-paru, dan ginjal, dll.
