Perbedaan utama antara auksin dan sitokinin adalah bahwa auksin menstimulasi percabangan akar sedangkan sitokinin menghambat percabangan akar dan pembentukan akar lateral. Selain itu, auksin terutama bertanggung jawab untuk pemanjangan sel di ujung batang dan akar sedangkan, sitokinin terutama bertanggung jawab untuk pembelahan sel dan karenanya, ditemukan di daerah tumbuh.
Fitohormon juga dikenal sebagai hormon tumbuhan adalah zat kimia penting untuk pertumbuhan dan perkembangan tanaman. Mereka adalah molekul organik, dan mereka bekerja sebagai molekul pemberi sinyal yang mengatur perkembangan tanaman. Ada lima jenis utama hormon tumbuhan: auksin, giberelin, sitokinin, etilen, dan asam absisat. Dengan demikian, mereka melakukan fungsi yang berbeda sendiri dan bersama-sama untuk mempengaruhi pertumbuhan tanaman.
