Perbedaan Utama - Transposase Bakteri vs Integrase Retroviral
Materi genetik yang dapat diangkut telah berevolusi dengan dua strategi utama untuk berpindah dari satu wilayah ke wilayah berikutnya di dalam dan di antara genom. Salah satu metode adalah dengan memindahkan melalui molekul RNA sebelum pembentukan molekul DNA sementara jalur lainnya melibatkan perantara DNA. Transposase dan integral virus adalah contoh materi genetik yang dapat ditransposisi. Transposase bakteri mengikat ujung transposon dan memfasilitasi katalisis pergerakan transposon ke bagian lain dari genom melalui berbagai mekanisme. Integrase retroviral adalah enzim yang membantu integrasi materi genetik retrovirus seperti HIV ke dalam materi genetik (DNA) sel inang yang diinfeksinya. Inilah perbedaan utama antara transposase bakteri dan integrase retroviral.
ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Transposase Bakteri
3. Apa itu Integrasi Retroviral
4. Persamaan Antara Transposase Bakteri dan Integrasi Retroviral
5. Perbandingan Berdampingan - Transposase Bakteri vs Integrasi Retroviral dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Apa itu Transposase Bakteri?
Transposase dapat didefinisikan sebagai enzim yang terikat pada ujung transposon yang memfasilitasi pergerakan transposon katalisis ke bagian lain dari genom melalui berbagai mekanisme. Mekanisme tersebut termasuk 'mekanisme potong dan tempel' dan 'mekanisme transposisi replikatif'. Transposase pertama kali diperkenalkan melalui kloning enzim yang dibutuhkan untuk transposisi transposon Tn3. Dua strategi penting telah digunakan oleh elemen genetik yang dapat dipindahkan untuk perpindahan antara genom atau dari satu situs ke situs lainnya. Pengangkutan melalui perantara RNA sebelum sintesis salinan DNA adalah salah satu strategi sementara yang lain terikat pada perantara DNA saja. Reaksi rekombinasi yang terlibat dalam integrasi kedua elemen terjadi karena enzim spesifik elemen. Jadi,Dalam contoh elemen DNA, enzim ini dikenal sebagai transposase sedangkan dalam contoh elemen RNA, mereka dikenal sebagai integrase.
Ketika membandingkan perbedaan antara kedua strategi transposisi, proses penyisipan tampak identik secara kimiawi. Tetapi, bukti terbaru mengusulkan bahwa kesamaan tertentu dalam mekanisme integrasi terlihat di daerah sekuens asam amino yang membentuk situs aktif; motif DDE. Lima famili transposase sedang diklasifikasikan saat ini, tetapi jumlah famili masih belum bertambah dengan karakter transposase baru. Keluarga-keluarga tersebut termasuk transposase DDE, transposase tirosin (Y), transposase Serin (S), transposase lingkaran bergulir, transkriptase terbalik / endonuklease (RT / En), dll. Keluarga-keluarga ini menggunakan mekanisme katalitik yang unik untuk pemecahan dan penggabungan kembali DNA. Transposase DDE melibatkan mekanisme potong dan tempel dari transposon asli dan membawa tiga set asam amino yang dilestarikan yaitu;aspartate (D), aspartate (D) dan glutamate (E). Transposase tirosin juga terlibat dalam mekanisme potong dan tempel dengan memanfaatkan residu tirosin, yang spesifik lokasi.
Gambar 01: Transposase Bakteri
Transposase serin melibatkan perantara DNA sirkuler dan melaksanakan mekanisme potong dan tempel seperti keluarga di atas. Transposase lingkaran bergulir terlibat dalam mekanisme penyalinan di mana satu untai langsung disalin ke situs target melalui replikasi DNA. Ini memastikan bahwa untai templat dan untai yang disalin memiliki untai yang baru disintesis. Reverse transcriptases / endonucleases transposase memiliki berbagai mekanisme transposisi.
Apa itu Retroviral Integrases?
Dalam konteks Retroviral Integrase, ini dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu integrasi materi genetik retrovirus seperti HIV ke dalam materi genetik (DNA) sel yang terinfeksi. Integralase retroviral ini paling sering disalahartikan sebagai integras fase. Contoh integral fasa adalah λ integral fasa. Tetapi ini adalah enzim yang sama sekali berbeda dan tidak perlu bingung. Sehubungan dengan pembentukan kompleks pra-integrasi retroviral, integrase retroviral memainkan peran utama. Protein integral retroviral biasanya terdiri dari tiga (03) domain kanonik. Domain ini dihubungkan dengan linker fleksibel.
Tiga domain tersebut mencakup domain pengikat seng terminal N di mana tiga bundel heliks dihubungkan dan distabilkan melalui koordinasi dengan keterlibatan Zn 2+kation, domain inti katalitik lipat RNase H dan domain ikatan DNA terminal C, yang merupakan lipatan SH3. Melalui penyelidikan dan melalui informasi biokimia dan struktural, menunjukkan bahwa integral retroviral memiliki kemampuan untuk berfungsi sebagai dimer dimer (tetramer). Dalam konteks multimerisasi dan pengikatan DNA virus, ketiga domain protein integrase retroviral. Fungsi utama integrase retroviral adalah memasukkan materi genetiknya ke DNA inang. Langkah ini adalah langkah paling penting dalam replikasi virus virus HIV. Setelah berhasil diintegrasikan, itu akan ada di DNA kromosom sel selama sisa umurnya.
Gambar 02: Retroviral Integrases
Oleh karena itu, sekali terintegrasi tidak ada pengembalian bagi sel. Integralase retroviral ini terlibat dalam katalisasi dua reaksi utama termasuk pemrosesan ujung 3 'dan ligasi kovalen. Selama pemrosesan ujung 3 ', 2-3 nukleotida dari kedua ujung 3' dari DNA virus dihilangkan dengan tujuan mengungkap dinukleotida CA dari ujung 3 'DNA virus, dan selama ligasi kovalen, ujung 3' yang diproses dari DNA virus diligasi secara kovalen ke dalam DNA kromosom inang.
Apa Persamaan Antara Transposase Bakteri dan Retroviral Integrases?
Transposase Bakteri dan Retroviral Integrase memiliki urutan asam amino yang serupa
Apa Perbedaan Antara Transposase Bakteri dan Integrase Retroviral?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Transposase Bakteri vs Integrase Retroviral |
|
| Bacterial Transposase adalah enzim yang terikat pada ujung transposon sekaligus memfasilitasi pergerakan transposon katalisis ke bagian lain dari genom melalui berbagai mekanisme. | Retroviral Integrases dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu integrasi materi genetik retrovirus seperti HIV ke dalam materi genetik (DNA) dari sel yang terinfeksi. |
| Wilayah yang Mengikat | |
| Daerah pengikatan spesifik yang tinggi diperlukan untuk Bakteri Transposase. | Kurang atau tidak ada urutan nukleotida yang diperlukan untuk pengikatan. |
Ringkasan - Transposase Bakteri vs Integrase Retroviral
Transposase bakteri dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu integrasi materi genetik retrovirus seperti HIV ke dalam materi genetik (DNA) sel yang terinfeksi. Dua strategi penting telah digunakan oleh elemen genetik yang dapat dipindahkan untuk perpindahan antara genom atau dari satu situs ke situs lainnya. Lima famili transposase sedang diklasifikasikan saat ini, tetapi jumlah famili masih belum bertambah dengan karakter transposase baru. Retroviral Integrase, itu dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu integrasi materi genetik retrovirus seperti HIV ke dalam materi genetik (DNA) sel yang terinfeksi. Protein integral retroviral biasanya terdiri dari tiga (03) domain kanonik. Fungsi utama integrase retroviral adalah memasukkan materi genetiknya ke DNA inang. Langkah ini adalah langkah paling penting dalam replikasi virus virus HIV. Oleh karena itu, sekali terintegrasi tidak ada pengembalian bagi sel. Inilah perbedaan antara Bakteri transposase dan Retroviral Integrase.
Unduh Bacterial Transposases vs Retroviral Integrases dalam format PDF
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini: Perbedaan Antara Transposase Bakteri dan Integrasi Retroviral
