Perbedaan Kunci - Ekstraksi DNA vs RNA
Studi tentang DNA dan RNA merupakan aspek penting untuk memahami konsep dasar biologi molekuler, bioteknologi, dan genetika. Ekstraksi sampel DNA dan RNA murni diperlukan untuk melaksanakan prosedur eksperimental selama studi ini. Perbedaan utama antara ekstraksi DNA dan RNA adalah bahwa proses ekstraksi DNA memurnikan DNA sementara ekstraksi RNA memurnikan RNA. Proses ekstraksi DNA memiliki tiga langkah berbeda: lisis sel dan katabolisme membran lipid dan protein, penggumpalan katabolit dengan larutan garam pekat dan pengendapan DNA dengan etanol. Prosedur tiga langkah dapat terdiri dari dua langkah opsional. Proses pemurnian RNA terdiri dari empat langkah berbeda: penambahan guanidium tiosianat untuk lisis sel, denaturasi protein termasuk ribonuklease,pemisahan RNA dengan penambahan kloroform dan fenol serta pencucian endapan menggunakan etanol.
ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Ekstraksi DNA
3. Apa itu Ekstraksi RNA
4. Persamaan Antara Ekstraksi DNA dan RNA
5. Perbandingan Berdampingan - Ekstraksi DNA vs RNA dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Apa itu Ekstraksi DNA?
Ekstraksi DNA adalah proses fisik dan kimia yang digunakan untuk memurnikan DNA dari sampel. Ekstraksi DNA merupakan aspek penting dalam konteks biologi molekuler dan ilmu forensik. Prosesnya terdiri dari tiga langkah dasar. Awalnya, sel yang diinginkan harus diperoleh. Selanjutnya, lisis sel difasilitasi untuk memecah membran sel, yang membuka sel dan mengekspos sitoplasma bersama dengan DNA. Surfaktan atau detergen lain dapat digunakan untuk melisiskan lipid dari membran sel sementara protein yang ada dikatabolisme oleh protease. Ini merupakan langkah opsional. Setelah sel dilisis, penggumpalan molekul yang dikatabolisme difasilitasi oleh larutan garam pekat. Ini diikuti dengan sentrifugasi larutan yang memisahkan gumpalan puing dari DNA. Di tahap ini,DNA yang telah dibedakan dicampur dengan reagen dan garam yang digunakan selama siklus sel.
Gambar 01: Ekstraksi DNA
Untuk memurnikannya lebih lanjut, langkah-langkah berikut dapat digunakan. Salah satu metode adalah pengendapan etanol, yang melibatkan pencampuran etanol dingin es dengan sampel DNA yang terpisah. DNA tidak larut dalam alkohol dan dengan demikian menghasilkan pelet karena agregasi molekul DNA bersama. Sodium asetat ditambahkan dalam proses ini untuk meningkatkan derajat pengendapan dengan meningkatkan kekuatan ionik. Selain proses pengendapan etanol, proses ekstraksi fenol-kloroform juga dapat diinduksi untuk ini. Dalam metode ini, fenol mengubah sifat protein yang ada dalam sampel. Setelah disentrifugasi, protein yang didenaturasi akan tetap berada dalam fase organik sedangkan molekul DNA yang dicampur dengan kloroform akan berada di fase air. Kloroform akan menghilangkan residu fenol. Setelah ekstraksi selesai,DNA tetap terlarut dalam buffer TE atau air ultra murni.
Apa itu Ekstraksi RNA?
Pemurnian RNA adalah proses dimana RNA dimurnikan dari sampel biologis. Karena adanya ribonuklease dalam sel dan jaringan, proses ini menjadi rumit. Enzim ribonuklease memiliki kemampuan mendegradasi RNA secara cepat. Sifat kimiawi ribonuklease sangat stabil, dan sulit untuk menonaktifkannya. Menetralkan ribonuklease adalah salah satu pilihan. Karena enzim ini ada di mana-mana di dalam sel dan jaringan, teknik khusus dikembangkan untuk ekstraksi RNA. Dari sekian banyak metode, metode yang umum adalah ekstraksi Guanidinium tiosinat-fenol-kloroform.
Gambar 02: Ekstraksi RNA
Metode ekstraksi Guanidinium tiosinat-fenol-kloroform bergantung pada sentrifugasi dan pemisahan fasa. Campuran yang akan disentrifugasi terdiri dari sampel encer dan larutan jenuh air yang terdiri dari fenol dan kloroform. Setelah disentrifugasi, larutan terdiri dari fase berair bagian atas dan fase organik yang lebih rendah dalam kondisi pH netral (pH 7-8). RNA hadir dalam fase air. Fase organik biasanya terdiri dari protein yang dilarutkan dalam fenol dan lipid yang dilarutkan dalam kloroform. Agen chaotropic (molekul yang memiliki kemampuan untuk memutus ikatan hidrogen antar molekul air) ditambahkan; ini dikenal sebagai, guanidinium tiosianat. Agen ini memiliki kemampuan untuk mendenaturasi protein yang termasuk ribonuklease yang dapat mendegradasi RNA dan terlibat dalam lisis sel. Ini juga memisahkan rRNA dari protein ribosom. Langkah terakhir pemurnian RNA adalah mencuci pengendapan fase air dengan etanol. RNA juga bisa dimurnikan menggunakan nitrogen cair.
Apa Persamaan Antara Ekstraksi DNA dan RNA?
- Kedua proses ekstraksi menggunakan bahan kimia berbahaya seperti fenol dan kloroform.
- Sentrifugasi adalah teknik penting untuk kedua proses.
- Etanol digunakan untuk mencuci endapan dan untuk mendapatkan DNA atau RNA yang dimurnikan.
Apa Perbedaan Antara Ekstraksi DNA dan RNA?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Ekstraksi DNA vs RNA |
|
| Ekstraksi DNA adalah proses yang mengekstraksi DNA dari suatu organisme atau sampel. | Ekstraksi RNA adalah proses yang mengekstrak RNA dari sampel. |
| Langkah | |
| Proses ekstraksi DNA terdiri dari tiga langkah berbeda dengan dua langkah opsional. | Proses ekstraksi RNA terdiri dari empat langkah berbeda. |
| Reagen | |
| Surfaktan, protease (opsional), alkohol, kloroform, fenol, natrium asetat digunakan untuk ekstraksi DNA. | Guanidium tiosianat, kloroform, fenol, etanol digunakan untuk ekstraksi RNA. |
Ringkasan - Ekstraksi DNA vs RNA
Ekstraksi DNA dan RNA adalah aspek penting dari prosedur eksperimental untuk studi biologi molekuler, genetika, dan bioteknologi. Kedua proses tersebut melibatkan pereaksi serupa, tetapi ekstraksi RNA menggunakan pereaksi khusus yang dikenal sebagai Guanidium tiosianat yang mengurangi aktivitas ribonuklease. Inilah perbedaan utama antara ekstraksi DNA dan RNA.
Unduh Versi PDF Ekstraksi DNA vs RNA
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silahkan download versi PDF disini Perbedaan Antara Ekstraksi DNA dan RNA
