Perbedaan utama antara snRNA dan snRNP adalah bahwa snRNA adalah molekul RNA nuklir kecil sedangkan snRNP atau ribonukleoprotein nuklir kecil adalah molekul RNA nuklir kecil dengan protein.
snRNA adalah non-coding, molekul RNA kecil yang aktif secara biologis dengan ukuran rata-rata 150 nukleotida. Mereka biasanya hadir dalam hubungan dengan protein sebagai snRNPs dalam keadaan alami. Oleh karena itu, snRNP adalah RNA inti kecil dengan beberapa protein spesifik snRNP. snRNP terlibat dalam mediasi atau pengaturan peristiwa pemrosesan RNA pasca-translasi seperti splicing, dll. Baik snRNA dan snRNP ditemukan dalam inti sel eukariotik.
