Perbedaan utama antara pemilihan penstabil dan penyeimbangan adalah bahwa seleksi penstabil adalah jenis seleksi alam yang mendukung fenotipe rata-rata dalam suatu populasi sementara penyeimbangan seleksi adalah pemeliharaan beberapa alel gen dalam suatu populasi untuk meningkatkan keragaman genetik.
Seleksi penstabil adalah jenis seleksi alam yang berlaku untuk sifat fenotipik. Ini mendukung fenotipe rata-rata dalam suatu populasi. Oleh karena itu, ini menghilangkan kedua jenis fenotipe ekstrim. Akhirnya membuat populasi menjadi seragam. Seleksi penyeimbang adalah beberapa proses selektif yang mempertahankan keragaman genetik yang menguntungkan dalam suatu populasi dengan mempertahankan banyak alel gen. Oleh karena itu, ini berlaku untuk lokus gen.
