Perbedaan utama antara Prototheria Metatheria dan Eutheria adalah bahwa Prototheria mengacu pada mamalia bertelur sedangkan Metatheria mengacu pada marsupial yang melahirkan anak-anak yang berkembang sebagian, dan Eutheria mengacu pada mamalia plasenta yang melahirkan anak-anak yang berkembang dengan baik.
Berdasarkan variasi utama dalam sistem reproduksi, mamalia dapat dikategorikan menjadi tiga subclass: Prototheria, Metatheria dan Eutheria. Prototheria termasuk mamalia yang paling primitif yaitu mamalia yang bertelur, terutama monotremata. Metatheria termasuk marsupial sementara Eutheria termasuk mamalia plasenta sejati. Faktanya, Eutheria adalah subclass mamalia terbesar.
