Perbedaan utama antara oomycetes dan zygomycetes adalah bahwa oomycetes tidak mengandung kitin di dinding selnya melainkan mengandung selulosa, beta glukan, dan asam amino hidroksiprolin sedangkan zygomycetes mengandung kitosan di dinding selnya. Perbedaan lain antara oomycetes dan zygomycetes adalah bahwa keadaan vegetatif oomycetes diploid sedangkan zygomycetes bersifat haploid atau dikariotik.
Oomycetes dan zygomycetes adalah organisme eukariotik mikroskopis. Oomycetes menyerupai jamur sejati. Tapi itu cetakan air. Zygomycetes merupakan salah satu kelas utama dari filum Zygomycota yang merupakan jamur sejati. Mereka ada di mana-mana, saprofit, jamur lingkungan.