Perbedaan utama antara homozigot dan heterozigot adalah bahwa homozigot berarti kedua alel serupa untuk suatu sifat sedangkan heterozigot berarti kedua alel berbeda untuk suatu sifat.
Gen yang diwarisi dari kromosom induk mengontrol semua karakter atau sifat hewan, tumbuhan, dan semua makhluk hidup lainnya. Itu adalah alasan inti untuk menunjukkan karakteristik orang tua pada keturunannya. Kebanyakan organisme eukariotik memiliki dua set gen yang dikenal sebagai gen maternal dan gen paternal. Oleh karena itu, keadaan genetik dikenal sebagai diploid (dua set kromosom). Itu berarti; semua sifat memiliki komponen genetik dari ibu dan ayah. Namun, gen ini dapat menjadi dominan atau resesif satu sama lain dan di situlah karakteristik homozigot dan heterozigot menjadi penting. Homozigot adalah keadaan memiliki dua alel dominan (AA) atau dua alel resesif (aa) sedangkan heterozigot adalah keadaan memiliki satu alel dominan dan satu alel resesif (Aa).