Perbedaan utama antara pengurutan senapan dan pengurutan generasi berikutnya adalah pengurutan senapan adalah metode pengurutan yang secara acak memecah urutan DNA menjadi banyak fragmen kecil dan menyusun kembali urutan dengan mengamati daerah yang tumpang tindih sementara Pengurutan Generasi Berikutnya (NGS) adalah metode lanjutan dari urutan genetik yang bergantung pada elektroforesis kapiler.
Pengurutan adalah proses yang menentukan urutan nukleotida yang tepat dalam gen, sekelompok gen, kromosom, dan genom lengkap. Sangat penting dalam studi genomik, studi forensik, virologi, sistematika biologi, diagnosis medis, bioteknologi dan dalam banyak bidang lainnya untuk menganalisis struktur dan fungsi gen dan identifikasi organisme. Selain itu, ada berbagai jenis metode pengurutan yang tersedia. Pengurutan Senapan dan Pengurutan Generasi Berikutnya adalah dua metode lanjutan di antaranya.