Perbedaan Utama - Microarray vs Pengurutan Generasi Berikutnya
Proses sekuensing DNA digunakan secara luas di bidang bioteknologi, virologi, diagnosis medis, dan ilmu forensik. Ini adalah proses yang menentukan urutan yang tepat dari nukleotida, adenin, guanin, timin, dan sitosin yang ada di dalam molekul DNA. Prosedur pengurutan DNA telah menjadi percepatan penemuan ajaib dalam penelitian medis dan biologi. Metode pengurutan ini telah berkembang hingga pengurutan genom lengkap organisme individu termasuk manusia dan spesies hidup lainnya. Microarrays dan Next Generation Sequencing adalah prosedur sekuensing DNA modern. Teknik microarray secara khusus didasarkan pada hibridisasi yang berisi sekumpulan target yang diketahui. Pengurutan generasi berikutnya didasarkan pada sintesis (yang menggunakan DNA polimerase untuk memasukkan nukleotida) dan memiliki kemampuan untuk mengurutkan seluruh genom terlepas dari target yang dipilih sebelumnya. Inilah perbedaan utama antara Microarray dan Pengurutan Generasi Berikutnya.
ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Microarray
3. Apa itu Pengurutan Generasi Berikutnya
4. Persamaan Antara Pengurutan Microarray dan Generasi Berikutnya
5. Perbandingan Berdampingan - Pengurutan Microarray vs Generasi Berikutnya dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Apa itu Microarray?
Microarray DNA digunakan sebagai alat laboratorium untuk mengidentifikasi ribuan ekspresi gen yang berbeda pada saat yang bersamaan. Ini adalah permukaan padat, yaitu slide mikroskop, yang berisi kumpulan bintik DNA mikroskopis yang tercetak di atasnya. Setiap tempat yang dicetak berisi urutan gen atau gen yang diketahui. Probe dikenal yang dicetak pada slide berfungsi sebagai probe untuk mendeteksi ekspresi gen. Ini dikenal sebagai transcriptome. Hibridisasi antara dua untai DNA adalah prinsip utama yang menjadi dasar mikroarray. Ini adalah pasangan basa komplementer dari urutan asam nukleat dengan pembentukan ikatan hidrogen.
Gambar 01: Microarray
Awalnya, molekul mRNA dikumpulkan dari sampel percobaan dan sampel referensi diperoleh dari individu yang sehat. Sampel eksperimental diperoleh dari individu yang sakit; misalnya, seseorang yang menderita kanker. Setelah diperoleh, kedua sampel mRNA diubah menjadi cDNA (DNA pelengkap). Selanjutnya, setiap sampel diberi label menggunakan probe fluoresen. Probe fluoresen memiliki warna berbeda untuk membedakan sampel cDNA dari cDNA referensi. Untuk memulai pengikatan molekul cDNA ke slide microarray, kedua sampel dicampur bersama. Hibridisasi adalah proses di mana molekul cDNA menempel pada probe DNA pada slide microarray. Setelah hibridisasi selesai,Serangkaian reaksi berlangsung untuk mengidentifikasi dan mengukur ekspresi setiap gen dengan kemunculan warna yang berbeda sesuai dengan jumlah gen yang diekspresikan. Hasil dari microarray digunakan dalam pembuatan profil ekspresi gen yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi berbagai kondisi penyakit.
Apa itu Pengurutan Generasi Berikutnya?
Next Generation Sequencing (NGS) adalah metode lanjutan dari pengurutan genetik. Prinsipnya mirip dengan Sanger Sequencing, yang bergantung pada elektroforesis kapiler. Di NGS, untai genomik terfragmentasi dan diikat ke untai templat. Basis setiap untai diidentifikasi oleh sinyal yang dipancarkan selama proses ligasinya. Dalam metode sekuens Sanger, tiga langkah terpisah, sekuensing, pemisahan, dan deteksi dilibatkan. Karena langkah-langkah terpisah ini, otomatisasi preparasi sampel dibatasi dalam throughput. Dalam NGS, teknik dikembangkan menggunakan pengurutan berbasis larik dengan kombinasi langkah-langkah prosedur pengurutan Sanger yang dapat menyebabkan jutaan rangkaian reaksi dilakukan secara paralel pada waktu yang bersamaan; ini menghasilkan kecepatan tinggi dan hasil dengan biaya rendah.
Gambar 02: Perkembangan NGS
NGS terdiri dari tiga langkah; persiapan perpustakaan (pembuatan perpustakaan dengan menggunakan fragmentasi acak DNA), amplifikasi (amplifikasi perpustakaan menggunakan amplifikasi klonal dan PCR) dan sekuensing. Proses sekuensing genom yang dilakukan dalam jangka waktu yang sangat lama dengan menggunakan prosedur sekuens Sanger dapat diselesaikan dalam hitungan beberapa jam menggunakan NGS.
Apa Persamaan Antara Microarray dan Pengurutan Generasi Berikutnya?
Baik Microarray dan Next Generation Sequencing dikembangkan menggunakan pengurutan berbasis array
Apa Perbedaan Antara Microarray dan Pengurutan Generasi Berikutnya?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Microarray vs Pengurutan Generasi Berikutnya |
|
| Microarray adalah kumpulan bintik DNA mikroskopis yang menempel pada permukaan padat, yang digunakan untuk mengukur tingkat ekspresi sejumlah besar gen secara bersamaan. | NGS (Next-generation sequencing) adalah teknologi sekuensing DNA throughput tinggi berbasis non-Sanger yang memfasilitasi jutaan atau miliaran untai DNA untuk diurutkan secara paralel. |
| Interaksi dengan Antigen | |
| Microarray didasarkan pada hibridisasi yang terdiri dari sekumpulan target yang diketahui. | NGS didasarkan pada sintesis yang menggunakan DNA polimerase untuk memasukkan nukleotida dan tidak bergantung pada target yang dipilih sebelumnya. |
Ringkasan - Microarray vs Pengurutan Generasi Berikutnya
Dalam konteks penelitian, pengurutan DNA telah menjadi pemercepat penting. Ini banyak digunakan dalam bioteknologi, diagnosis medis, dan studi forensik. Ini telah berkembang dan berkembang menjadi prosedur pengurutan yang lebih efisien dan cepat. Mikroarray dan NGS adalah dua teknik pengurutan DNA tingkat lanjut yang ada. Keduanya dikembangkan menggunakan pengurutan berbasis array. Teknik microarray bergantung pada hibridisasi sedangkan NGS didasarkan pada sintesis, yang menggunakan DNA polimerase untuk memasukkan nukleotida. Inilah perbedaan utama antara Microarray dan Pengurutan Generasi Berikutnya.
Unduh Versi PDF Microarray vs Pengurutan Generasi Berikutnya
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silahkan download versi PDF disini Perbedaan Antara Microarray dan Next Generation Sequencing
