Perbedaan utama antara siklus Krebs dan glikolisis adalah bahwa siklus Krebs, yang terjadi di mitokondria, merupakan tahap kedua dari respirasi sel, sedangkan glikolisis, yang terjadi di sitoplasma, adalah tahap pertama respirasi sel.
Siklus Krebs dan glikolisis adalah dua tahap utama respirasi sel yang menghasilkan energi dalam sel. Kedua proses tersebut terjadi di lokasi seluler yang berbeda. Selain itu, mereka menggunakan reaksi enzimatik yang berbeda untuk mengubah bahan awal yang berbeda menjadi produk yang berbeda. Lebih lanjut, kedua proses ini membuat jumlah ATP yang berbeda. Dalam respirasi aerobik, siklus Krebs mengikuti glikolisis. Tetapi dalam respirasi anaerobik, glikolisis terjadi sendiri.