Perbedaan utama antara sel induk embrionik dan somatik adalah bahwa sel induk embrionik adalah sel tak berdiferensiasi pluripoten yang memiliki asal embrionik sedangkan sel induk somatik adalah sel tak berdiferensiasi multipoten yang berasal dari jaringan dan organ.
Sel induk adalah sel yang tidak berdiferensiasi yang mampu tumbuh menjadi jaringan atau organ yang sebenarnya. Secara umum, ada dua jenis sel induk utama yaitu sel induk embrionik dan sel induk dewasa (sel induk somatik). Dalam kasus diferensiasi, sel induk embrionik dapat berdiferensiasi menjadi semua jenis sel. Sebaliknya, sel induk somatik hanya dapat berdiferensiasi menjadi beberapa sel khusus jaringan. Oleh karena itu, sel induk embrionik bersifat majemuk sedangkan sel induk somatik bersifat multipoten. Dengan kata sederhana, kemampuan diferensiasi tinggi pada sel induk embrionik dibandingkan dengan sel induk somatik.
