Perbedaan utama antara vakuola dan vesikel adalah bahwa vakuola adalah kantung besar yang terikat membran yang digunakan sebagai penyimpanan sedangkan vesikel adalah kantung kecil yang terikat membran yang digunakan sebagai penyimpanan dan untuk mengangkut di dalam sel eukariotik.
Sel seperti sekantong bahan kimia, yang mampu bertahan hidup dan menggandakan diri. Membran sel memisahkan interior sel dari lingkungan luar dalam sel hewan. Oleh karena itu, pada sel tumbuhan, dinding sel merupakan batas luar yang memisahkan interior sel dari lingkungan luarnya. Secara umum, suatu sel mengandung berbagai jenis organel di dalam sitoplasma-nya. Organel-organel ini termasuk nukleus, aparatus Golgi, mitokondria, retikulum endoplasma, ribosom, sentriol, vesikula, dll.