Perbedaan utama antara variasi somatik dan variasi germinal adalah bahwa variasi somatik adalah variasi genetik yang terjadi pada sel somatik sedangkan variasi germinal adalah variasi genetik yang terjadi pada sel germinal seperti telur atau sperma.
Variasi genetik mengacu pada proses perubahan materi genetik suatu organisme atau perbedaan urutan DNA antar individu dalam suatu populasi. Urutan DNA dapat berubah seiring waktu dari generasi ke generasi. Rekombinasi genetik merupakan salah satu mekanisme utama yang menyebabkan variasi genetik. Selain itu, mutasi juga dapat menyebabkan variasi genetik. Secara genetik, organisme multiseluler memiliki dua jenis sel utama; sel somatik dan sel germinal. Karenanya, variasi genetik terdiri dari dua jenis; mereka adalah variasi somatik dan variasi germinal. Jika variasi genetik terjadi pada sel somatik, kita menyebutnya variasi somatik, dan jika variasi genetik terjadi pada sel germinal, kita menyebutnya variasi germinal. Variasi somatik sebagian besar tidak dapat diturunkan sedangkan variasi germinal sebagian besar dapat diwariskan.
