Perbedaan utama antara asam amino hidrofobik dan hidrofilik adalah bahwa asam amino hidrofobik bersifat nonpolar sedangkan asam amino hidrofilik bersifat polar.
Asam amino adalah bahan penyusun protein. Protein adalah molekul polimer raksasa yang merupakan komponen penting dari semua organisme hidup. Selanjutnya, asam amino terutama dalam dua jenis sebagai asam amino esensial dan nonesensial. Selain itu, kita dapat mengkategorikannya sebagai asam amino hidrofilik dan hidrofobik, tergantung pada sifat fisikokimianya. Mereka berbeda satu sama lain terutama berdasarkan polaritasnya.