Perbedaan utama antara asam amino glukogenik dan ketogenik adalah bahwa asam amino glukogenik menghasilkan piruvat atau prekursor glukosa lainnya selama katabolisme mereka sementara asam amino ketogenik menghasilkan asetil KoA dan asetoasetil KoA selama katabolisme mereka.
Asam amino adalah molekul fundamental, yang menyusun struktur kimia protein dan polipeptida. Meskipun ada klasifikasi berbeda untuk asam amino, kita dapat mengklasifikasikannya sebagai asam amino glukogenik dan ketogenik bergantung pada zat antara yang terbentuk selama katabolisme. Seperti disebutkan di atas, produk akhir katabolisme asam amino menghasilkan dua jenis produk antara; baik piruvat (atau prekursor glukosa lainnya) atau asetil KoA dan asetoasetil KoA.