Perbedaan utama antara ovarium dan ovula adalah ovarium adalah bagian dari struktur reproduksi wanita yang berkembang menjadi buah tanaman berbunga sedangkan bakal biji adalah struktur yang berkembang menjadi benih tanaman berbiji.
Bunga merupakan struktur reproduksi tumbuhan berbunga. Beberapa bunga sempurna sementara beberapa bunga tidak sempurna. Bunga sempurna mengandung bagian reproduksi jantan dan betina masing-masing sebagai androecium dan gynoecium. Gynoecium memiliki tiga komponen utama yaitu stigma, stilus dan ovarium. Karenanya, ovarium adalah struktur yang mengandung bakal biji. Kita bisa menemukannya di dasar gynoecium. Dengan demikian, ovula adalah struktur yang mengandung sel reproduksi wanita atau sel telur. Ovarium mengelilingi ovula berbunga. Satu ovarium mungkin mengandung banyak ovula, tetapi satu ovula sering kali mengandung satu sel telur (gamet betina). Setelah pembuahan, ovarium dan bakal biji berkembang menjadi struktur buah yang berbeda.
