Perbedaan utama antara klorofil A dan B adalah bahwa klorofil A adalah pigmen fotosintesis utama pada tumbuhan dan alga, sedangkan klorofil B adalah pigmen aksesori yang mengumpulkan energi dan beralih ke klorofil A.
Klorofil adalah keluarga pigmen alami yang ada pada tumbuhan dan alga dan bertanggung jawab atas warna hijau mereka. Klorofil menyerap energi dari sinar matahari dan memanfaatkan energi ini untuk mensintesis karbohidrat dari air dan karbon dioksida. Ini adalah proses yang disebut fotosintesis yang menopang proses kehidupan di semua tumbuhan karena kebutuhan energinya dipenuhi melalui proses ini. Selanjutnya, fotosintesis adalah proses utama yang menopang semua organisme hidup karena tumbuhan adalah produsen utama semua rantai makanan. Hewan dan manusia mengkonsumsi produk tumbuhan. Dalam keluarga pigmen klorofil, ada beberapa jenis pigmen klorofil. Diantaranya, klorofil A dan klorofil B adalah dua jenis klorofil. Mereka memiliki struktur yang mirip dengan sedikit perbedaan pada cincin porfirin. Klorofil A memiliki C H3 gugus pada cincin porfirin sedangkan klorofil B memiliki C H O (gugus aldehida) pada cincin porfirin.