Perbedaan utama antara stomata dan sel penjaga adalah bahwa stomata adalah pori-pori yang terletak di epidermis daun, batang, dll., Sedangkan sel penjaga adalah sel yang mengelilingi dan mengatur pembukaan dan penutupan stomata.
Respirasi dan fotosintesis adalah dua proses penting pada tumbuhan. Dalam kedua proses tersebut, pertukaran gas penting. Stomata dan sel penjaga memfasilitasi pekerjaan pertukaran gas pada tumbuhan. Di sini, sel penjaga adalah sel parenkim, dan mereka adalah sel yang mengelilingi stomata. Transpirasi sel penjaga mengontrol, yang merupakan proses penting tanaman yang menjaga tanaman tetap sehat. Selanjutnya sel penjaga mengandung klorofil. Oleh karena itu, mereka juga mampu berfotosintesis.
