Perbedaan utama antara substrat dan situs aktif adalah bahwa substrat adalah senyawa kimia yang dapat mengalami reaksi kimia sedangkan situs aktif adalah wilayah spesifik pada enzim.
Enzim adalah katalis biologis. Ini adalah protein yang dapat menurunkan energi aktivasi reaksi kimia untuk mengurangi penghalang energi reaksi tersebut. Oleh karena itu, dapat meningkatkan laju reaksi. Reaktan dari reaksi yang melibatkan enzim adalah "substrat". Substrat ini berikatan dengan situs aktif enzim. Reaksi berlangsung di sana. Akhirnya, ia melepaskan produk reaksi.
